Las visitas guiadas a la Iglesia de la Magdalena tendrán lugar dos días a la semana, los jueves, en horario de 11:00 h. y 17:30 h., y los sábados, en horario de 11:00 h. La reserva de las visitas se debe realizar a través de Alma Mater Museum, mediante el número de teléfono 976399488 y la dirección de correo electrónico info@almamatermuseum.com. El precio de las visitas guiadas a la Iglesia de la Magdalena es de 5€, si bien en el caso de los poseedores de carnet joven, carnet de estudiante, familias numerosas, mayores de 65 años y menores de 18 años el precio es de 3€.

Durante los aproximadamente cincuenta minutos que duran las visitas guiadas a la Iglesia de la Magdalena es posible conocer no sólo la historia de la iglesia, si no las partes del edifico como son la nave principal y sus capillas laterales, el retablo mayor de estilo barroco datado en el siglo XVIII, la cripta ubicada en su parte inferior y subida a la torre mudéjar.